Le 30 avril 1791, l'église est fermée au culte. Le 17 décembre 1791, l'église, le presbytère, le cimetière et les constructions entourant le chœur sont vendus comme biens nationaux pour 101 000 livres. L’église a servi de magasin, pendant que la tour accueillait l’atelier d’une fonderie de plomb de chasse.
En 1867, la tour a été réparée sans que la flèche octogonale, qui la couronnait et enlevée en 1683 par un ouragan, ne soit remontée. Lors du percement de la rue de l'Impératrice (actuelle rue Jeanne-d'Arc) en 1861, l’église est détruite et il n’est conservé que la tour.