Elle a été construite dès l'origine avec le concours des religieux de l'Abbaye Saint Bertin de Saint Omer, décimateurs de la paroisse.
Encore marqué par l'Art Roman et l'Art Gothique, l'édifice est de structure basilicale. Il est formé de 3 vaisseaux nef, et bas côtés, d'un transept saillant dont la croisée porte le clocher, et d'un vaste choeur à bas-côtés et chapelles latérales.
L'Eglise Saint Jean-Baptiste a été en partie détruite par le feu lors de l'offensive allemande sur Dunkerque en Mai 1940.